Tras consumar el ascenso en el año 2002, el «azul» no descendió nunca más a Primera B.
En la máxima categoría del fútbol regional, Atlético San Basilio jugó 584 partidos: ganó 230, empató 168 y perdió 186. Fue campeón del Torneo Clausura 2006, Clausura y Anual 2010 y Clausura 2011.
Alejandro Larrea, Lucas Beltritti, Juan José Bono e Iván Testa, emblemas de Atlético en la primera década de 2000, recuerdan los primeros pasos por la Primera A de la Liga Regional.